La ocurrencia de Liópez de dar amnistía a los grupos del crimen organizado con tal de lograr la paz, le ha traído múltiples críticas y en particular de las fuerzas armadas del país. Los secretarios de la Defensa Nacional, general Salvador Cienfuegos, y de la Marina Armada de México, almirante Vidal Soberón, le han contestado claramente que están en contra. De un plumazo, dice Gil, Liópez se ha enemistado con el Ejército.
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