Pedro Caixinha ha dejado el banquillo del Cruz Azul, y tras su salida, se han comenzado a manejar a los posibles candidatos para hacerse de la dirección técnica de La Máquina; entre la baraja de estrategas, destaca Juan Francisco Palencia, esto por su pasado celeste.
En su estancia en La Noria, el Gatillero, como también se le conocía, conquistó un par de títulos de la Concacaf, el campeonato del Invierno 97’, y el subcampeonato de la Copa Libertadores, en el año 2001. En lo que consta a la selección, fue parte del equipo en los Mundiales de 1998 y 2002, además de estar presente en la Copa Confederaciones de 1999.
Asimismo, Palencia fue por una oportunidad a Europa donde se colocó en el RCD Espanyol de Barcelona. Militó en España una temporada y disputó 31 partidos en los que anotó seis goles para los periquitos.
Palencia también fue jugador de las Chivas y de Universidad Nacional, club en donde logró ser campeón del torneo Clausura 2009 y del 2011.
Para su trayectoria como director técnico, inició con el club Sant Cugat en España, equipo de la juvenil A, pero tras la salida de Guillermo Vázquez, en el 2016, decidió regresar a México para tomar la batuta de la Universidad Nacional.
Después de concluir un fallido intento con los Pumas en el torneo Apertura 2017, tardó un año para que se convirtiera en el nuevo entrenador de Lobos BUAP, con el fin de mantenerlos en la primera división mexicana.