En México, se han identificado 223 casos con la variante Delta de covid-19, descrita en la India con el linaje B.1.617.2 y que circula en 12 entidades del país, pero que básicamente se concentra en la Ciudad de México.
Alberto Cedro Tanda, investigador en ciencias médicas y coordinador del proyecto de secuenciación de SARS-CoV-2 en el Instituto Nacional de Medicina Genómica (Inmegen), explicó que 66.7 por ciento de las muestras secuenciadas en la Ciudad de México, en las dos primeras semanas de junio, reportó un predominio de la variante.
En mayo, la variante Delta representaba 3.8 por ciento de las muestras positivas en la Ciudad de México y en las dos primeras semanas de junio ya significan 66.7 por ciento de las muestras recibidas en la red de laboratorios de secuenciación genérica.
En entrevista con MILENIO, dijo que la variante de interés B.1.1.519, que circulaba en la Ciudad de México, ya fue desplazada por la Delta: “En mayo 47.1 por ciento de las muestras pertenecía a esta variante (a punto de ser clasificada por la Organización Mundial de la Salud) y en la actualidad, hasta la primera mitad de junio, los casos positivos con B.1.1.519 son 5.6 por ciento”.
A nivel nacional, la variante Delta representaba 2.9 por ciento del total de muestras secuenciadas en mayo y en la actualidad, considerando las dos primeras semanas de junio, alcanza 16.5 por ciento.
En la plataforma GISAID (Global Initiative on Sharing All Influenza Data), donde todos los países reportan mutaciones de diferentes virus, la variante Delta en el país, hasta el corte de finales de mayo, registraba únicamente 28 casos secuenciados con el linaje B.1.617.2, y en la actualidad la cifra se elevó a 223, siendo el último reporte con una toma de muestra del 18 de junio.
Estados con más casos
Las entidades que han reportado casos con la variante Delta, de acuerdo con la plataforma GISAID, son Ciudad de México con 117; Estado de México con 27; Baja California Sur y Sinaloa con 26, cada una. Asimismo, Yucatán con 8; Michoacán y Quintana Roo con 6 en cada una; Jalisco y Nuevo León con 2 en cada una; Guerrero, Hidalgo y Puebla con 1 en cada estado.
En este informe no se incluye a San Luis Potosí, la entidad en la que un grupo de capacitadores extranjeros, ocho de la India y dos de Brasil, estuvieron entre el 6 y 8 de marzo e introdujeron la variante Delta.
El caso índice data del 5 de abril, en un residente. Tras una búsqueda intencionada, de acuerdo con las autoridades locales de San Luis Potosí, detectaron 11 casos de enfermos, solo en cuatro pudieron efectuar la secuenciación genética por la calidad de las muestras y a ellos sumaron 30 personas asociadas como parte del estudio del brote.
Según las autoridades de San Luis Potosí, lograron controlar la propagación de la variante Delta; sin embargo, llegó días después a Sinaloa a través de los tripulantes de un buque mercante petrolero que arribó al Puerto de Mazatlán el 2 de mayo procedente de Texas y que finalizó su recorrido en el Puerto de Mazatlán, de acuerdo con la investigación de MILENIO. Se detectaron, primero, 14 casos en Sinaloa, ocho de los cuales fueron pasajeros de dicho navío de gran tamaño.
Ese buque hizo parada en Michoacán donde, al inicio, detectaron cinco casos con tomas de muestra desde el 11 de mayo. Luego comenzó a expandiese aceleradamente: solo habían tres personas de la Ciudad de México (dos con toma de muestra el 5 de mayo y otro el 6 de mayo); una en el Estado de México (12 Mayo) y una en Jalisco (21 de abril).
Más de 200 contagios en México
Hoy esa cifra es de 223 oficiales en todo país y se encuentra en 12 entidades que reportan y mandan muestras en condiciones adecuadas para hacer ese estudio de detección genómico.
El impacto de la variante Delta se observa, explicó Cedro Tanda, en el Reino Unido, donde ya se había vacunado a su población con el biológico de AstraZeneca y actualmente enfrenta una nueva ola de casos de contagios.
El fin de semana, Reino Unido reportó 18 mil 270 nuevos casos en un día, una cifra sin precedentes desde finales de febrero, en medio de un repunte por la aparición de la variante Delta, de especial virulencia, que también impulsó récord de casos y muertes en la capital rusa y provocó una expansión de restricciones en países como Tailandia, Malasia y Australia.
Variante Delta, en más de 85 países
La variante Delta está presente en más de 85 países, de acuerdo con la Organización Mundial de la Salud (OMS).
Las farmacéuticas AstraZeneca y Pfizer-BioNTech aseguraron que sus vacunas son “ampliamente eficaces“ contra hospitalizaciones por la variante Delta y Kappa, identificadas por primera vez en India. Esto está sustentado en los resultados de los investigadores del PHE (Public Health England) y del NIRH (National Institute for Health Research).
En esta investigación se explica que la vacuna de Pfizer evita las hospitalizaciones en 96 por ciento cuando se han aplicado las dos dosis y 94 por ciento si sólo se han inoculado con una; mientras AstraZeneca también es muy efectiva con dos dosis, con 92 por ciento, aunque no tiene tanto alcance cuando sólo se ha puesto una dosis. No obstante reduce las hospitalizaciones en 71 por ciento.
The Lancet publicó que la variante de preocupación Delta, anteriormente conocida como VOC, se convirtió en la cepa dominante de SARS-CoV-2 en Escocia.
“Del 1 de abril al 28 de mayo de 2021, la última fecha hasta la que se disponía de datos, el 97 por ciento del gen los casos positivos secuenciados en Escocia fueron la variante Delta”.
La investigación analiza la efectividad de la vacunas a partir de estudiar a la población que, hasta el 6 de junio de 2021, había recibido una dosis, 59.4 por ciento, y dos dosis, 39.4 por ciento. En adultos mayores las proporciones correspondientes fueron 91.7 y 88.8 por ciento, de una y dos dosis.
Hubo 19 mil 543 infecciones confirmadas por SARS-CoV-2 durante el período de interés, de las cuales 377 fueron ingresadas en el hospital por covid-19; 7 mil 723 (39.5%) de estos casos y 134 (35.5%) ingresos hospitalarios fueron en los que eran positivos para el gen S, variante Delta. Los casos positivos ocurrieron en todas las edades, con una mayor proporción de cinco a nueve años.
“En resumen, mostramos que Delta en Escocia se encontró principalmente en grupos más jóvenes y ricos. El riesgo de ingreso hospitalario por covid-19 se duplicó aproximadamente en aquellos con Delta en comparación con el Alpha (variante descrita en Reino Unido con el linaje B.117) , con un riesgo de ingreso particularmente mayor en aquellos con cinco o más comorbilidades relevantes”.
De acuerdo con The Lancet, “la vacuna Oxford-AstraZeneca pareció menos eficaz que la vacuna Pfizer-BioNTech para prevenir la infección por SARS-CoV-2 en personas con Delta VOC. Dada la naturaleza observacional de estos datos, las estimaciones de la eficacia de la vacuna deben interpretarse con cautela”.
Otras variantes
La variante B.1.351 descrita en Sudáfrica, bautizada como Beta, ha tenido un ligero incremento, con 19 casos, ubicados en Baja California y Campeche, Estado de México, entre otros. La variante Alfa, descrita en el Reino Unido con el linaje B.117 hay 1 mil 118; con la P1, se Brasil ahora llamada Gamma, 963 casos.
En la plataforma GISAID, México ha secuenciación 13 mil 112 genomas de SARS-CoV-2 secuenciados de variantes, básicamente, por los institutos nacionales de Medicina Genómica (Inmegen) y el de Diagnóstico y Referencia Epidemiológica (INDRE).
“Dos Institutos Nacionales de Salud han secuenciado el 51% de estos genomas, Inmegen e INDRE, 26% y 25%, respectivamente. En Ciudad de México, desde el inicio de la pandemia, Inmegen ha secuenciado el 66% de las muestras subidas a la plataforma GISAID y el 60% del Estado de México. Con la colaboración de Salud Digna, Inmegen comenzó a secuenciar en el último mes muestras provenientes de los estados del sureste del país: Quintana Roo (40%), Yucatán (30%) y Tabasco (24%)”.
Llama la atención que en Quintana Roo y en Yucatán es más prevalente la P1, con 55 y 46 por ciento de las muestras secuenciadas. Existen confirmados 177 y 256 en Quintana Roo y en Yucatán, respectivamente con la P1.
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